MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880202

Total Repeats: 406

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013163	TAA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062241
2	NC_013163	A	6	6	42	47	100 %	0 %	0 %	0 %	257062241
3	NC_013163	AAGA	2	8	136	143	75 %	0 %	25 %	0 %	257062241
4	NC_013163	CCA	2	6	164	169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062241
5	NC_013163	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062241
6	NC_013163	AAT	2	6	232	237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062241
7	NC_013163	TCA	2	6	239	244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062241
8	NC_013163	ATT	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062241
9	NC_013163	TGA	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062241
10	NC_013163	AT	3	6	326	331	50 %	50 %	0 %	0 %	257062241
11	NC_013163	TACT	2	8	347	354	25 %	50 %	0 %	25 %	257062241
12	NC_013163	GAT	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062241
13	NC_013163	GTT	2	6	426	431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062241
14	NC_013163	CATAA	2	10	466	475	60 %	20 %	0 %	20 %	257062241
15	NC_013163	TTAG	2	8	531	538	25 %	50 %	25 %	0 %	257062242
16	NC_013163	TGC	2	6	585	590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062242
17	NC_013163	GCA	2	6	682	687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062242
18	NC_013163	GAG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062242
19	NC_013163	TTTG	2	8	711	718	0 %	75 %	25 %	0 %	257062242
20	NC_013163	AGG	2	6	726	731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062242
21	NC_013163	AGG	2	6	771	776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062242
22	NC_013163	TTAA	2	8	841	848	50 %	50 %	0 %	0 %	257062242
23	NC_013163	TG	3	6	879	884	0 %	50 %	50 %	0 %	257062242
24	NC_013163	ATTG	2	8	960	967	25 %	50 %	25 %	0 %	257062242
25	NC_013163	TTCT	2	8	973	980	0 %	75 %	0 %	25 %	257062242
26	NC_013163	TAC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062242
27	NC_013163	TCT	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062242
28	NC_013163	AGA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062242
29	NC_013163	GTT	2	6	1356	1361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062242
30	NC_013163	TCT	2	6	1429	1434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062242
31	NC_013163	CTT	2	6	1489	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062242
32	NC_013163	GAA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062242
33	NC_013163	AGA	2	6	1536	1541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062242
34	NC_013163	TAA	2	6	1625	1630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062242
35	NC_013163	A	6	6	2556	2561	100 %	0 %	0 %	0 %	257062243
36	NC_013163	GAT	2	6	2563	2568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062243
37	NC_013163	TGGA	2	8	2640	2647	25 %	25 %	50 %	0 %	257062243
38	NC_013163	TTA	2	6	2700	2705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062243
39	NC_013163	CTT	2	6	2711	2716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062243
40	NC_013163	GA	3	6	2802	2807	50 %	0 %	50 %	0 %	257062243
41	NC_013163	TCT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062243
42	NC_013163	GATT	2	8	2864	2871	25 %	50 %	25 %	0 %	257062243
43	NC_013163	T	6	6	3183	3188	0 %	100 %	0 %	0 %	257062244
44	NC_013163	ATT	2	6	3272	3277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062244
45	NC_013163	TCC	2	6	3317	3322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062244
46	NC_013163	T	8	8	3329	3336	0 %	100 %	0 %	0 %	257062244
47	NC_013163	TGA	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062244
48	NC_013163	T	6	6	3380	3385	0 %	100 %	0 %	0 %	257062244
49	NC_013163	CAAT	2	8	3390	3397	50 %	25 %	0 %	25 %	257062244
50	NC_013163	CAG	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062244
51	NC_013163	AATT	2	8	3467	3474	50 %	50 %	0 %	0 %	257062244
52	NC_013163	AAATT	2	10	3499	3508	60 %	40 %	0 %	0 %	257062244
53	NC_013163	GCA	2	6	3550	3555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062244
54	NC_013163	ACT	3	9	3591	3599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062244
55	NC_013163	GTA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062244
56	NC_013163	TAA	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062244
57	NC_013163	GAG	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062244
58	NC_013163	ACCC	2	8	3689	3696	25 %	0 %	0 %	75 %	257062244
59	NC_013163	AAT	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062244
60	NC_013163	ATGG	2	8	3746	3753	25 %	25 %	50 %	0 %	257062244
61	NC_013163	TTG	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062244
62	NC_013163	ATG	2	6	3887	3892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062244
63	NC_013163	TTGA	2	8	3899	3906	25 %	50 %	25 %	0 %	257062244
64	NC_013163	GTTC	2	8	3948	3955	0 %	50 %	25 %	25 %	257062244
65	NC_013163	CTT	2	6	3990	3995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
66	NC_013163	TCT	2	6	4028	4033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
67	NC_013163	TGC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062244
68	NC_013163	TGT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062244
69	NC_013163	T	7	7	4163	4169	0 %	100 %	0 %	0 %	257062244
70	NC_013163	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062244
71	NC_013163	TTC	2	6	4217	4222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
72	NC_013163	CCT	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062244
73	NC_013163	TCT	2	6	4284	4289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
74	NC_013163	AAAG	2	8	4296	4303	75 %	0 %	25 %	0 %	257062244
75	NC_013163	CAAT	2	8	4314	4321	50 %	25 %	0 %	25 %	257062244
76	NC_013163	GA	3	6	4356	4361	50 %	0 %	50 %	0 %	257062244
77	NC_013163	AT	3	6	4368	4373	50 %	50 %	0 %	0 %	257062244
78	NC_013163	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062244
79	NC_013163	ATAG	2	8	4460	4467	50 %	25 %	25 %	0 %	257062244
80	NC_013163	CGG	2	6	4550	4555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062244
81	NC_013163	TTTTC	2	10	4579	4588	0 %	80 %	0 %	20 %	257062244
82	NC_013163	AAC	2	6	5070	5075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062245
83	NC_013163	AGC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062245
84	NC_013163	GTT	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062245
85	NC_013163	TAA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062245
86	NC_013163	GTT	2	6	5196	5201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062245
87	NC_013163	GTG	3	9	5224	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062245
88	NC_013163	CAC	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062246
89	NC_013163	ACC	2	6	5600	5605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062246
90	NC_013163	CAT	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062246
91	NC_013163	GCT	2	6	5630	5635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062246
92	NC_013163	CGT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062246
93	NC_013163	TGC	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062246
94	NC_013163	ACA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062246
95	NC_013163	ACGG	2	8	5718	5725	25 %	0 %	50 %	25 %	257062246
96	NC_013163	TTAA	2	8	5854	5861	50 %	50 %	0 %	0 %	257062247
97	NC_013163	ATT	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062247
98	NC_013163	ATT	2	6	5929	5934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062247
99	NC_013163	CAA	2	6	5964	5969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062247
100	NC_013163	AAC	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062247
101	NC_013163	TAA	2	6	6253	6258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062247
102	NC_013163	TCA	3	9	6322	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062248
103	NC_013163	CTT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062248
104	NC_013163	CTA	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062248
105	NC_013163	CTT	2	6	6410	6415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062248
106	NC_013163	TAA	2	6	6441	6446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062248
107	NC_013163	T	6	6	6462	6467	0 %	100 %	0 %	0 %	257062248
108	NC_013163	TAAC	2	8	6476	6483	50 %	25 %	0 %	25 %	257062248
109	NC_013163	ATA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062248
110	NC_013163	CGT	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
111	NC_013163	TCC	2	6	6570	6575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062249
112	NC_013163	C	6	6	6574	6579	0 %	0 %	0 %	100 %	257062249
113	NC_013163	CGT	2	6	6596	6601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
114	NC_013163	CAA	2	6	6659	6664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062249
115	NC_013163	T	7	7	6730	6736	0 %	100 %	0 %	0 %	257062249
116	NC_013163	GCT	2	6	6772	6777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
117	NC_013163	C	6	6	6786	6791	0 %	0 %	0 %	100 %	257062249
118	NC_013163	TCC	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062249
119	NC_013163	C	6	6	6905	6910	0 %	0 %	0 %	100 %	257062249
120	NC_013163	C	7	7	6925	6931	0 %	0 %	0 %	100 %	257062249
121	NC_013163	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062249
122	NC_013163	T	6	6	7106	7111	0 %	100 %	0 %	0 %	257062249
123	NC_013163	CCG	2	6	7193	7198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062249
124	NC_013163	TTA	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062249
125	NC_013163	GTC	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
126	NC_013163	AAG	2	6	7333	7338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062249
127	NC_013163	CCG	3	9	7402	7410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062249
128	NC_013163	ATT	2	6	7448	7453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062249
129	NC_013163	CTAA	2	8	7659	7666	50 %	25 %	0 %	25 %	257062250
130	NC_013163	CATC	2	8	7693	7700	25 %	25 %	0 %	50 %	257062250
131	NC_013163	ACCAA	2	10	7779	7788	60 %	0 %	0 %	40 %	257062250
132	NC_013163	CATCTC	2	12	7865	7876	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	257062250
133	NC_013163	CAA	2	6	7894	7899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062250
134	NC_013163	AGCG	2	8	8087	8094	25 %	0 %	50 %	25 %	257062251
135	NC_013163	TAA	2	6	8117	8122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062251
136	NC_013163	TCC	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062251
137	NC_013163	TCA	2	6	8350	8355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062251
138	NC_013163	TGT	2	6	8477	8482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062251
139	NC_013163	ATT	2	6	8513	8518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062251
140	NC_013163	CTT	2	6	8535	8540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062251
141	NC_013163	TCA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062251
142	NC_013163	CCG	2	6	8669	8674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062251
143	NC_013163	ACAT	2	8	8703	8710	50 %	25 %	0 %	25 %	257062251
144	NC_013163	TCC	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062251
145	NC_013163	GTCCC	2	10	8775	8784	0 %	20 %	20 %	60 %	257062251
146	NC_013163	C	6	6	8782	8787	0 %	0 %	0 %	100 %	257062251
147	NC_013163	CAC	2	6	8840	8845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062251
148	NC_013163	AAAGT	2	10	8936	8945	60 %	20 %	20 %	0 %	257062251
149	NC_013163	CTT	2	6	8953	8958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062251
150	NC_013163	GT	3	6	9042	9047	0 %	50 %	50 %	0 %	257062252
151	NC_013163	GCT	2	6	9074	9079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062252
152	NC_013163	CAG	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062252
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154	NC_013163	AATC	2	8	9146	9153	50 %	25 %	0 %	25 %	257062252
155	NC_013163	CAC	2	6	9180	9185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062252
156	NC_013163	GCA	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062252
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158	NC_013163	GCT	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062252
159	NC_013163	ACG	2	6	9455	9460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062253
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161	NC_013163	TCAG	2	8	9537	9544	25 %	25 %	25 %	25 %	257062253
162	NC_013163	ATT	2	6	9642	9647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062253
163	NC_013163	TC	3	6	9839	9844	0 %	50 %	0 %	50 %	257062254
164	NC_013163	GAC	3	9	9884	9892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
165	NC_013163	GAC	2	6	9932	9937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
166	NC_013163	TGG	2	6	9958	9963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062254
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168	NC_013163	AACAC	2	10	10040	10049	60 %	0 %	0 %	40 %	257062254
169	NC_013163	ATC	2	6	10109	10114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062254
170	NC_013163	AGCC	2	8	10135	10142	25 %	0 %	25 %	50 %	257062254
171	NC_013163	GCA	2	6	10192	10197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
172	NC_013163	AAC	2	6	10199	10204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062254
173	NC_013163	AGC	2	6	10230	10235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
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175	NC_013163	AAG	2	6	10343	10348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062254
176	NC_013163	TAGT	2	8	10373	10380	25 %	50 %	25 %	0 %	257062254
177	NC_013163	G	6	6	10444	10449	0 %	0 %	100 %	0 %	257062255
178	NC_013163	T	7	7	10453	10459	0 %	100 %	0 %	0 %	257062255
179	NC_013163	A	6	6	10564	10569	100 %	0 %	0 %	0 %	257062256
180	NC_013163	TCC	2	6	10590	10595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062256
181	NC_013163	T	6	6	10609	10614	0 %	100 %	0 %	0 %	257062256
182	NC_013163	TCAC	2	8	10620	10627	25 %	25 %	0 %	50 %	257062256
183	NC_013163	TCA	2	6	10635	10640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062256
184	NC_013163	CATT	2	8	10726	10733	25 %	50 %	0 %	25 %	257062256
185	NC_013163	TTG	2	6	10769	10774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062256
186	NC_013163	TCGCCC	2	12	10777	10788	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	257062256
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191	NC_013163	TTTGA	2	10	11020	11029	20 %	60 %	20 %	0 %	257062257
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202	NC_013163	TCAT	2	8	11660	11667	25 %	50 %	0 %	25 %	257062257
203	NC_013163	AC	3	6	11702	11707	50 %	0 %	0 %	50 %	257062257
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211	NC_013163	AGACTC	2	12	12304	12315	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257062257
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220	NC_013163	C	7	7	13709	13715	0 %	0 %	0 %	100 %	257062258
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234	NC_013163	ATT	2	6	14330	14335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062259
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240	NC_013163	GA	3	6	14632	14637	50 %	0 %	50 %	0 %	257062259
241	NC_013163	CAT	2	6	14667	14672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062259
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244	NC_013163	AG	4	8	14702	14709	50 %	0 %	50 %	0 %	257062259
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246	NC_013163	TAA	2	6	14882	14887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062259
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250	NC_013163	CAA	2	6	15009	15014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062259
251	NC_013163	TAA	2	6	15179	15184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062259
252	NC_013163	CCA	2	6	15197	15202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062259
253	NC_013163	TCC	2	6	15258	15263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062259
254	NC_013163	ATC	2	6	15352	15357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062259
255	NC_013163	ATT	2	6	15359	15364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062259
256	NC_013163	GGGA	2	8	15395	15402	25 %	0 %	75 %	0 %	257062259
257	NC_013163	G	6	6	15461	15466	0 %	0 %	100 %	0 %	257062259
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259	NC_013163	A	6	6	15505	15510	100 %	0 %	0 %	0 %	257062259
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262	NC_013163	TCT	2	6	15811	15816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062260
263	NC_013163	TCA	2	6	15847	15852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062260
264	NC_013163	AG	3	6	15988	15993	50 %	0 %	50 %	0 %	257062260
265	NC_013163	TTG	2	6	15998	16003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062260
266	NC_013163	T	6	6	16031	16036	0 %	100 %	0 %	0 %	257062260
267	NC_013163	G	6	6	16090	16095	0 %	0 %	100 %	0 %	257062260
268	NC_013163	T	6	6	16106	16111	0 %	100 %	0 %	0 %	257062260
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394	NC_013163	T	7	7	23353	23359	0 %	100 %	0 %	0 %	257062264
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397	NC_013163	AAG	2	6	23400	23405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062264
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399	NC_013163	TCT	2	6	23449	23454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062264
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401	NC_013163	T	6	6	23498	23503	0 %	100 %	0 %	0 %	257062264
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.